Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC52A3Q9NQ40 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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