Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms