Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GABARAPL3Q9BY60 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABARAPL3Q9BY60 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms