Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TDRD1Q9BXT4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms