Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PI4K2AQ9BTU6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms