Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MESP1Q9BRJ9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MESP1Q9BRJ9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms