Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms