Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ECSITQ9BQ95 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ECSITQ9BQ95 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms