Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NPAS2Q99743 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms