Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms