Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNBD2Q96M20 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNBD2Q96M20 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms