Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PRIMPOLQ96LW4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms