Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RUNDC1Q96C34 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms