Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKD1Q969G9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms