Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFKQ969G6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms