Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms