Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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RABGGTAQ92696 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGGTAQ92696 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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