Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMPDL3BQ92485 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMPDL3BQ92485 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms