Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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C17orf47Q8NEP4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf47Q8NEP4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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