Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF248Q8NDW4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms