Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C10orf53Q8N6V4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C10orf53Q8N6V4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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