Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
VPS8Q8N3P4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS8Q8N3P4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms