Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME9Q86XW9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME9Q86XW9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME9Q86XW9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME9Q86XW9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME9Q86XW9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME9Q86XW9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms