Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TXNDC2Q86VQ3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC2Q86VQ3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms