Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG4DQ86TL0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG4DQ86TL0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms