Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HACD2Q6Y1H2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms