Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CARMIL2Q6F5E8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CARMIL2Q6F5E8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms