Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ANKRD39Q53RE8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PIGN-226ENST00000638591 2776 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ANKRD39Q53RE8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms