Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DNAL1Q4LDG9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAL1Q4LDG9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms