Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KNOP1Q1ED39 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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