Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM187BQ17R55 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM187BQ17R55 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms