Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ATP6V1FQ16864 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ATP6V1FQ16864 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms