Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCK2Q16822 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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