Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDK4Q16654 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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