Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CTF1Q16619 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms