Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NECTIN1Q15223 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NECTIN1Q15223 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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NECTIN1Q15223 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NECTIN1Q15223 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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