Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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BRD3Q15059 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BRD3Q15059 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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