Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNC3Q14003 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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KCNC3Q14003 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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KCNC3Q14003 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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KCNC3Q14003 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNC3Q14003 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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