Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBFBQ13951 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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