Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGA9Q13797 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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