Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNA1SQ13698 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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