Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CUL4BQ13620 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL4BQ13620 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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