Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ATRQ13535 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ATRQ13535 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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