Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMAD4Q13485 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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