Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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FOXE3Q13461 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FOXE3Q13461 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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