Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.974e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.235e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.993e-27■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.033e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.193e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.661e-8■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.61e-8■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.556e-11■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NDUFS2-205ENST00000468828 899 ntTSL 313.76□□□□□ -0.211e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NDUFS2-213ENST00000493849 910 ntTSL 36.15□□□□□ -1.421e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SNRPD2-207ENST00000588599 805 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.191e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.24e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.164e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.094e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.334e-15■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NEDD8-204ENST00000526430 286 ntTSL 313.43□□□□□ -0.268e-9■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CPTP-202ENST00000464957 1101 ntTSL 237.22■■■■□ 3.551e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 REXO4-204ENST00000454825 833 ntTSL 329.62■■■□□ 2.331e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.262e-16■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.088e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.798e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 STUB1-207ENST00000566181 510 ntTSL 323.31■■□□□ 1.328e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.168e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.151e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.151e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-207ENST00000436324 1045 ntTSL 222.04■■□□□ 1.128e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.111e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 YIPF3-208ENST00000490447 1321 ntTSL 221.82■■□□□ 1.081e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SPNS1-206ENST00000564476 890 ntTSL 321.81■■□□□ 1.084e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-219ENST00000491183 527 ntTSL 221.79■■□□□ 1.088e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.058e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.058e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-212ENST00000479586 841 ntTSL 221.6■■□□□ 1.058e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-209ENST00000463631 583 ntTSL 321.35■■□□□ 1.018e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-210ENST00000464078 508 ntTSL 521.35■■□□□ 1.018e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NCAPD3-205ENST00000526787 1226 ntTSL 320.61■□□□□ 0.896e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.764e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-214ENST00000482733 701 ntTSL 219.75■□□□□ 0.758e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RCHY1-203ENST00000504085 1123 ntTSL 1 (best)18.73■□□□□ 0.598e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HILPDA-204ENST00000481454 1370 ntTSL 218.45■□□□□ 0.541e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.468e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MYO18A-206ENST00000529889 698 ntTSL 217.94■□□□□ 0.461e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.461e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-208ENST00000443046 823 ntTSL 317.88■□□□□ 0.458e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NCAPD3-213ENST00000534532 5539 ntTSL 217.78■□□□□ 0.446e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.48e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.394e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.382e-16■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HILPDA-203ENST00000466473 904 ntTSL 516.95■□□□□ 0.31e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RCHY1-213ENST00000514589 2443 ntTSL 216.23■□□□□ 0.198e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CHD3-211ENST00000481999 2515 ntTSL 216.09■□□□□ 0.171e-6■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 UFC1-204ENST00000473766 888 ntTSL 215.06■□□□□ 01e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.021e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZFR-201ENST00000265069 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.026e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.041e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.151e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 UFC1-203ENST00000467540 803 ntTSL 513.87□□□□□ -0.191e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 COPZ1-204ENST00000548281 554 ntTSL 413.69□□□□□ -0.221e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 COPZ1-214ENST00000552218 797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.261e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 COPZ1-213ENST00000551962 578 ntTSL 513.4□□□□□ -0.261e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 FBXW2-204ENST00000493559 2154 ntTSL 213.32□□□□□ -0.284e-14■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.288e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MADD-216ENST00000469699 924 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.388e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TACC1-211ENST00000520973 2564 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.411e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TMEM161B-213ENST00000514135 2035 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TIMELESS-203ENST00000553532 5121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.436e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TRIM35-204ENST00000521283 619 ntTSL 212.31□□□□□ -0.441e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 SCG3-202ENST00000542355 2163 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.446e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.441e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 MAST2-203ENST00000372009 4047 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.451e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CHD3-208ENST00000470531 3744 ntTSL 211.83□□□□□ -0.521e-6■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 B4GALT2-205ENST00000481924 1004 ntTSL 211.65□□□□□ -0.541e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 COPZ1-212ENST00000551779 1462 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.591e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CHD3-201ENST00000330494 7328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TIMELESS-201ENST00000229201 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.636e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TIMELESS-205ENST00000557589 2784 ntTSL 211.02□□□□□ -0.646e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 HMGN1-202ENST00000380747 709 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.658e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 DROSHA-202ENST00000442743 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.661e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 NCAPD3-214ENST00000534548 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.666e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.676e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CPEB1-217ENST00000618698 2885 ntTSL 210.58□□□□□ -0.722e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CPEB1-207ENST00000611031 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TMEM161B-205ENST00000506536 2328 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.721e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TMEM161B-201ENST00000296595 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.751e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 DROSHA-201ENST00000344624 5102 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.751e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 ZFR-205ENST00000507465 1140 ntTSL 510.38□□□□□ -0.756e-12■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 POGZ-203ENST00000368863 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.751e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 STX18-210ENST00000515687 1183 ntTSL 210.27□□□□□ -0.778e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 CPEB1-209ENST00000614918 4882 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.82e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.81e-7■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 STX18-203ENST00000503692 3497 ntTSL 1 (best)10.04□□□□□ -0.88e-10■■□□□ 13.3
PABPC4Q13310 TMEM161B-209ENST00000511087 2804 ntTSL 1 (best)9.91□□□□□ -0.821e-7■■□□□ 13.3
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