Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SCGB2A2Q13296 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms