Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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CHAF1AQ13111 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CHAF1AQ13111 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CHAF1AQ13111 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1AQ13111 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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