Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN3Q13064 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN3Q13064 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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