Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BNIP3Q12983 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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BNIP3Q12983 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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BNIP3Q12983 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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BNIP3Q12983 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BNIP3Q12983 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BNIP3Q12983 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BNIP3Q12983 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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BNIP3Q12983 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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